2005年安徽中医药大学中医五官科学被国家教育部正式批准为硕士学位授予点。目前有7名硕士研究生指导老师，4名校内指导老师，3名校外指导老师。共招收11届研究生，培养34名研究生，在校生13人，毕业21人，毕业率100%，就业率100%。2012年以来本专业的生源情况较好，能从第一志愿录取，录取情况满意，录取分数逐年提高。2012年录取考生平均分289,最低分285,国家控制线265；2013年年录取考生平均分285.3,最低分275,国家控制线275；2014年录取考生平均分311,最低分307,国家控制线280；2015年录取考生平均分324,最低分301,国家控制线285；2016年录取考生平均分327,最低分311,国家控制线295。

本学位点依托国家中医药临床研究基地，安徽中医药大学第一附属医院耳鼻咽喉科。2007年安徽中医药大学第一附属医院耳鼻咽喉科被国家中医管理局确定为国家“十一五”重点专科，国家中医药管理局重点专科协作组建设单位、“暴聋”专病协作组副组长单位，2009年安徽省中医药学会耳鼻咽喉科专业委员会挂靠单位，安徽省变态反应研究中心参与单位，国家首批中医学术流派“新安郑氏喉科学术流派工作室建设项目”挂靠单位。目前全科共有12名医务人员，其中7名具有高级技术职称，安徽省名中医2人，硕士研究生8人，目前拥有编制床位45张，年门诊量50000人次，特色院内制剂7种，承担安徽中医药大学中医五官科学本科、研究生的理论及临床教学任务。学位点着重围绕新安医学研究，有三个研究方向：（1）新安医学治疗咽喉热病（感染性疾病）研究；（2）新安医学治疗炎性鼻病（鼻鼽、鼻窒、鼻渊）研究；（3）新安医学针药并用对耳鸣耳聋的临床及实验研究。